1、“生物样本库(biobank)是一种集中保存各种人类生物材料(human biologicalmaterial),用于疾病的临床治疗和生命科学研究的生物应用系统”。是标准化收集、处理、储存和管理人类离体器官、组织、细胞、血液、体液、分泌物、排泄物及其生物大分子衍生物等各种生物样本,以及生物样本捐赠者的临床诊治、随访等信息的机构。生物样本库有多种类型,包括组织(新鲜组织、冰冻组织、病理石蜡包埋组织等)、器官库、体液样本(血液、血液成分、尿液、唾液、脑脊液、关节腔液、腹水等)、细胞(细胞株(系)和干细胞)库、粪便和核酸分子(dna和rna)库等。
2、国内临床样本库包括多病种综合型样本库和专科或专病样本库,如重大疾病样本库、肿瘤疾病样本库、肝脏疾病和艾滋病样本库、遗传性疾病样本库等;有血库和细胞库,如脐带血库、干细胞库、生殖细胞库、免疫细胞库等。上述实体库的建设包含了样本采集、处理、贮存及使用的系列过程,其中样本的采集与处理是生物样本库的核心工作,实体库库容的数量和质量体现了样本库规模与支撑服务保障能力。肿瘤是中国乃至全球最常见、病死率最高的疾病之一。肿瘤患者的体液、手术切除组织及其相关的临床病理资料是获取更多遗传和分子信息的基础材料。手术切除作为肿瘤的主要治疗方式之一,与其他疾病相比,在肿瘤组织样本的采集上具备更多的优势,离体肿瘤组织在满足病理诊断之后,大量剩余组织可用于科学研究。因此,建立大规模的、具备完善临床信息的肿瘤生物样本库是一项造福人类的工程,将促使基础科学研究成果快速应用于临床,为寻找肿瘤特异标志物、新药靶标奠定基础,最终用于肿瘤的预防、早期诊断和精准治疗。肿瘤生物样本库建设是对肿瘤样本主体和样本衍生物的管理。肿瘤样本主体是肿瘤生物样本库建设的基础和核心。肿瘤个体化精准治疗的新型医疗模式需要高质量的生物样本、可靠的临床资料及准确的生物信息等。其中,肿瘤样本的质量是肿瘤生物样本库建设的核心和基础。样本的质量包括样本的疾病种类和样本的数量。因此,肿瘤样本,尤其是肿瘤组织样本的采集和质控是肿瘤生物样本库建设和发展的基石。
3、肿瘤组织生物样本的采集时,为保证获得高质量样本,需要遵守严格的取材采集规范和原则,包括病理医师对肿瘤病变大小是否适合采集样本的判断、病理医师对所采集样本的病理学质控、无菌无酶取材、取材器械和用品的无菌无酶的处理和全程低温环境的维持等。生物样本采集应保证捐赠者的利益,生物组织样本取材不能影响常规临床病理诊断。生物样本采集应避免采集多余不必要的样本,采集的过程应尽量减少捐赠者的痛苦。因此,肿瘤组织样本采集规范和原则明确指出对于肿瘤直径小于0.5cm、癌前病变、放化疗后未见明显癌变的组织以及穿刺活检组织不应采集肿瘤组织生物样本,以防影响病理诊断结果。在保证病理诊断且肿瘤组织直径≥2cm的前提下,由病理医师在30min内,按照取材规范切取相应肿瘤组织、正常组织(癌/瘤旁组织3~5cm以外或最远处)和癌/瘤旁组织(癌/瘤组织旁1cm)。因此,肿瘤组织直径 2cm或更小(直径≥ 0.5cm)的小肿瘤病变,按照现有常规规范要求只能满足病理诊断的需求而无法进行肿瘤组织生物样本的采集。而目前随着影像学等检查技术的进步和发展以及健康体检早诊筛查意识的增强,很多肿瘤性病变发现时直径 2cm或更小,这便造成无法采集肿瘤组织生物样本的困难局面,影响和制约肿瘤生物样本库的建设和发展。
1、针对上述存在的问题,本发明提供了一种小肿瘤病变生物样本采集方法,旨在在术中冰冻病理诊断(保证病理诊断)时采集直径2cm或更小(直径≥0.5cm)的小肿瘤组织的生物样本,解决小肿瘤病变样本的生物样本采集难题;尽最大可能保证肿瘤生物样本库建设和发展的质和量方面的需求,保证肿瘤生物样本库建设和发展的规模(样本病种和样本数量);本发明的目的是通过下述方案得以实现的:
5、s3:使用恒温冷冻切片机对oct复合物包埋冷冻后的小肿瘤病变标本进行修块,完成小肿瘤病变生物样本的采集;
6、s4:将完成修块的小肿瘤病变标本制作成冰冻组织切片,用于病理诊断及质控评估。
8、在标本托上涂一层冷冻包埋剂oct,然后将取材后的新鲜标本安放在标本冷冻托上,稍冷冻后,再用oct包埋剂覆盖标本,再冷冻,待组织1/2-2/3被冷冻后再压冷冻锤,加速冷冻。
10、先将oct 滴加在标本托上,冻制成一个小冷台,将组织放在制成的小冷台上,再覆盖oct冷冻,并用冷冻锤轻PG国际,PG国际有限公司,PG游戏入口,PG平台轻压平。
12、s301:将oct复合物包埋后的标本冷冻完成后再将标本托固定在恒温冷冻切片机的机头上,调整机头的位置,使其恰好位于切片刀的后方;
14、s303:以粗切削的方式进行修块,使用连续转动方式削至少8-10个切面后,使用一次性生物样本隔离收集器将修块时修掉的肿瘤组织样本进行采集;
15、s304:取下一次性生物样本隔离收集器,在恒温冷冻切片机的-20℃机箱内,将样本转移至冻存管中,然后放入液氮罐中。
16、进一步的,步骤s302中所述生物样本采集套装包括无菌无dna及rna酶的一次性手套、一次性切片刀片、一次性毛笔/刷子、一次性镊子、一次性剪刀和一次性生物样本隔离收集器。
17、进一步的,所述一次性生物样本隔离收集器用于在切片过程中临时收集生物样本。
19、s401:确认切片厚度后,放下防卷板,使完成修块的小肿瘤病变标本位置恰好与切片刀的刀刃完全平行,并略突出刀刃;
21、s403:打开防卷板,用载玻片轻压组织,使其平整地吸附到载玻片上。
23、不使用防卷板,缓慢转动切片机手轮,用毛笔展开组织,并用载玻片轻压组织,使其平整地吸附到载玻片上
25、1.根据肿瘤生物样本的临床采集原则,临床病理诊断和病理取材规范和原则发现小肿瘤病变(肿瘤组织直径 2cm或更小(直径≥0.5cm))无法进行肿瘤生物样本的采集,本发明专利将无法采集生物样本的小肿瘤病变变成可采集生物样本的病变,而且能实现高质量采集,同时获得肿瘤生物样本的质控(组织样本质量评估和病理状况评价)。突破肿瘤生物样本采集的瓶颈。是肿瘤生物样本采集原则方面的创新,是肿瘤生物样本采集流程方面的新发现,保证肿瘤生物样本采集这一肿瘤生物样本库建设的核心工作的进行。
26、2.本发明专利的术中冰冻生物样本采集套装保证肿瘤生物样本采集器材的无菌、无dna及rna酶和无污染,保证肿瘤生物样本采集原则的实施,是肿瘤生物样本采集器材方面的创新。
27、3.一次性生物样本隔离收集器是本发明专利术中冰冻生物样本采集套装中的核心发明,解决了肿瘤生物样本采集过程中的污染问题,解决了在恒温冷冻切片机的冷冻箱中无法在低温条件下灭菌及灭dna及rna酶而完成连续采样的问题。一次性生物样本隔离收集器的使用保证了采样的质量,保证了采样的速度而又不影响术中冰冻制片的时效性和病理诊断结果发布的时效性。是保障术中冰冻过程中完成连续小肿瘤病变生物样本采集的创新设备。发明了恒温冷冻切片机的新配件,开发了恒温冷冻切片机的新功能。为应用恒温冷冻切片机进行小肿瘤病变生物样本采集的转化应用提供了实践基础。拓展了恒温冷冻切片机的应用领域。
28、4.本发明专利解决小肿瘤病变的生物样本采集难题并保证样本质量。本发明专利涉及的生物样本采集过程未给患者带来额外风险(人身和心理风险),而且不会影响患者的诊断和治疗。尽最大可能保证肿瘤生物样本库建设和发展的质和量方面的需求,保证肿瘤生物样本库建设和发展的规模(样本病种和样本数量)。珍贵和丰富的小肿瘤病变生物样本资源是开展细胞生物学、分子生物学、分子病理学、基因组学和蛋白质组学等系统生物学研究,探讨新的疾病分类、分型、诊断、个性化治疗和预后标准,制订疾病预测、早期检测、分子分型与个性化治疗、预后评估等新型的诊治策略的基础。是提高药物筛选的效率,缩短药物敏感性和特异性开发周期的基础。是转化医学和精准医学顺利发展的重要支撑。生物样本库,尤其是肿瘤生物样本库的建设和发展是创新型国家建设的重要内容;是国家精准医疗战略实施的前提;是研究型医院与学科建设的基础。